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Metadaten

Weitere mitwirkende Personen, Institutionen oder UnternehmenMüller-Reichert, Thomas - EZ_CFCI (ORCID: 0000-0003-0203-1436) - ProjectLeader
Für den Inhalt der Forschungsdaten verantwortliche Person(en)Kiewisz, Robert - EZ-CFCI (ORCID: 0000-0003-2733-4978)
Beschreibung der weiteren DatenverarbeitungReconstruction in IMOD, Modeling in ZIB Amira, Analysis in ASGA v0.35
Verwendete ForschungsinstrumenteFEI F30
Verwendete ForschungsinstrumenteWohlwend HPF compact 03
Verwendete ForschungsinstrumenteLeica AFS II
Verwendete ForschungsinstrumenteLeica ultramicrotome UC5
KurzbeschreibungThis collection of datasets belongs to the eLife paper titled "Three-dimensional structure of kinetochore-fibers in human mitotic spindles": The collection includes all raw datasets of three HeLa Kyoto metaphase cells, that were acquired using electron tomography technique. This collection is also included all processed data as well as analysis as were shown in the publication.
Angewendete Methoden oder Verfahrenhigh-pressure freezing, freeze substitution, epond infiltration and embedding, serial sectioning, Electron tomography
InhaltsverzeichnisMetaphase_#1 ├── Analysis_ASGA_v0.35 # Excel sheets containing all analyzed results obtained from ASGA v0.35 ├── MT_Models # 3D spatial graph models of MTs in HeLa #1 │ └── T_0475_meta_7A-7C_spatialgraph_All_MTs.am │ └── T_0475_meta_7A-7C_spatialgraph_ASGA_Analysis.am │ └── T_0475_meta_7A-7C_spatialgraph_KMTs.am │ └── T_0494_meta_10B-10E_spatialgraph_ASGA_Analysed.am ├── Surfaces # 3D models obtained from tomographic volume segmentation with Zib Amira │ └── T_0475_meta_7A-7C_Centrosome.am │ └── T_0475_meta_7A-7C_Chromosome.am └── Tomogram_Stack # Tomographic volume saved in binary .am format Metaphase_#2 ├── Analysis_ASGA_v0.35 # Excel sheets containing all analyzed results obtained from ASGA v0.35 ├── MT_Models # 3D spatial graph models of MTs in HeLa #2 │ └── T_0479_meta_15A-15C_spatialgraph_All_MTs.am │ └── T_0479_meta_15A-15C_spatialgraph_ASGA_Analysis.am │ └── T_0479_meta_15A-15C_spatialgraph_KMTs.am │ └── T_0479_meta_15A-15C_spatialgraph_ASGA_Analysed.am ├── Surfaces # 3D models obtained from tomographic volume segmentation with Zib Amira │ └── T_0479_meta_15A-15C_Centrosome.am │ └── T_0479_meta_15A-15C_Chromosome.am └──Tomogram_Stack # Tomographic volume saved in binary .am format Metaphase_#3 ├── Analysis_ASGA_v0.35 # Excel sheets containing all analyzed results obtained from ASGA v0.35 ├── MT_Models # 3D spatial graph models of MTs in HeLa #3 │ └── T_0494_meta_10B-10E_spatialgraph_All_MTs.am │ └── T_0494_meta_10B-10E_spatialgraph_ASGA_Analysis.am │ └── T_0494_meta_10B-10E_spatialgraph_KMTs.am │ └── T_0494_meta_10B-10E_spatialgraph_ASGA_Analysed.am ├── Surfaces # 3D models obtained from tomographic volume segmentation with Zib Amira │ └── T_0494_meta_10B-10E_Centrosome.am │ └── T_0494_meta_10B-10E_Chromosome.am └──Tomogram_Stack # Tomographic volume saved in binary .am format
Länder, auf die sich die Daten beziehenGERMANYde
Region(en) auf die sich die Daten beziehenSaxony
Spracheeng
Entstehungsjahr oder Entstehungszeitraum2021
Veröffentlichungsjahr2021
HerausgeberTechnische Universität Dresden
HerausgeberRobert Kiewisz
Referenzen auf ergänzende MaterialienIsPartOf: 123456789/1958 (Handle)
Inhalt der ForschungsdatenText, Model: 3D tomographic model of HeLa cell obtained with 300kV TEM
Inhaber der NutzungsrechteTechnische Universität Dresden
Nutzungsrechte des DatensatzesCC-BY-4.0
Eingesetzte SoftwareResource Production: IMOD 4.12.8
Eingesetzte SoftwareResource Production: Zib Amira 2021.05
Eingesetzte SoftwareResource Production: ASGA 0.35
Angabe der FachgebieteBiologyde
Angabe der FachgebieteLife Sciencede
Titel des DatensatzesHeLa metaphase spindle tomographic data sets and analysis


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